Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEPT3Q9UH03 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms