Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
REREQ9P2R6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REREQ9P2R6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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