Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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