Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM30AQ9NV96 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms