Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSU72Q9NP77 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms