Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms