Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms