Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRHQ9HD43 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms