Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms