Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NXF3Q9H4D5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms