Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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