Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms