Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms