Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC46A2Q9BY10 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms