Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281 ms