Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTKNQ9BST9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms