Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLF1Q9BQI6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLF1Q9BQI6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms