Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms