Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TREX2Q9BQ50 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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