Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SEMA3CQ99985 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SEMA3CQ99985 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SEMA3CQ99985 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SEMA3CQ99985 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA3CQ99985 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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