Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD5Q99717 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms