Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CSPG4P5Q96PW8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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