Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPR78Q96P69 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms