Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
C9orf85Q96MD7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms