Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms