Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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