Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCSTNQ92542 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms