Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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