Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHDC9Q8NEP7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms