Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSAMQ8N6F7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms