Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms