Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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