Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYT9Q86SS6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYT9Q86SS6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms