Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNNM4Q6P4Q7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms