Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q6P435 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q6P435 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6P435 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q6P435 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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