Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms