Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SLC3A1-208ENST00000410056 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC016738.2-203ENST00000433012 489 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL035420.2-201ENST00000433587 616 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL109754.1-201ENST00000449270 1036 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL161785.1-201ENST00000455981 583 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC010973.1-201ENST00000479085 511 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 LINC01021-202ENST00000505775 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AL162574.3-201ENST00000623209 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C4orf48Q5BLP8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms