Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms