Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms