Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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