Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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