Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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