Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMD5Q16401 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms