Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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