Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITSN1Q15811 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITSN1Q15811 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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