Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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