Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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