Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NWD1Q149M9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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