Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NR1D2Q14995 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR1D2Q14995 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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