Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAPQ14761 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms